NGS vs.桑格测序

新一代测序和桑格测序的差别

从原理上说，桑格测序与新一代测序（NGS）技术背后的概念是相似的。在NGS和桑格测序（也称为双脱氧测序或毛细管电泳测序）的过程中，DNA聚合酶会将有荧光的核苷酸逐个添加到正在延长的DNA模板链上。通过荧光标记识别每个掺入的核苷酸。

桑格测序与NGS的主要差异在于测序量。桑格测序一次只能对一条DNA片段进行测序，而NGS可以进行大规模平行测序，即每次运行可同时对数百万个片段进行测序。这意味着这样的过程一次可对数百到数千个基因进行测序。NGS还具有更强的探索能力，可以通过深度测序检测新型或罕见变异。

NGS相较于桑格测序的优势

NGS的优势包括：

经济高效地筛查更多样本
检测跨转录组区域的多种变异
提高测序深度、突变分辨率/灵敏度和发现能力
更高的灵敏度，可检测低频变异^{1, 2}
周转时间更快，可检测的样本量更高³
全面覆盖整个基因组
检测限更低^{4, 5}
可进行样本多重分析，支持大容量测序
能够同时测序数百到数千个基因或基因区域

桑格测序与NGS的比较

	桑格测序桑格测序可检测目标基因。	靶向NGS 靶向NGS可同时对数百至数千个基因进行测序。
优势^1-7	熟悉的工作流程对1-20个靶标进行测序时具有成本效益	高测序深度带来高灵敏度（低至1%）更强的探索能力* 更高的突变分辨率† 大规模平行测序实现了高通量工作流程和大型数据集检测低至10%的基因表达变化
挑战^1-7	灵敏度低（检测限约15%–20%）、通量低、发现能力较差对20个靶标以上不具成本效益	针对少数靶标的简单检测，效率不够高

* 探索能力为鉴定新型变异的能力。

† 突变分辨率是指鉴定的突变大小。NGS可以进行大的染色体重排到单核苷酸变异的鉴定。

使用NGS代替桑格测序

观看此动画，了解简单易用的因美纳NGS技术如何补充您的桑格测序工作。

观看视频

“使用桑格测序，我们只能看到有限的DNA快照……使用NGS及其大规模平行测序我们能够获得每个样本的数万到数十万个reads。”

Michael Bunce博士
科廷大学客座教授

何时使用NGS？何时使用桑格测序？

对少量样本或少量基因组靶点（≤20个）的小DNA区域进行测序时，桑格测序是一个很好的选择。其他情况下则靶向NGS更能满足您的需求。NGS可让您经济有效地筛查更多的样本，检测基因组目标区域的多个变异——如果使用桑格测序开展这些分析则昂贵且耗时。

NGS应用和方法

无论您的研究重点是什么，NGS都可以发挥重要作用，针对不同类型的样本，使用各种已发表方法，寻求各种生物学问题的答案。NGS通过无假设的实验设计，发掘有关癌症、微生物学、遗传病、生殖健康、农业等领域的新知识。

深入了解NGS应用

使用桑格测序但对NGS感到好奇？

如果您对针对具体研究重点的NGS有任何疑问，我们很乐意为您提供帮助。我们的专家可以回答任何问题并针对您的具体情况推荐合适的解决方案。

与专家对话

参考文献

Jamuar SS, Lam AT, Kircher M, et al.Somatic mutations in cerebral cortical malformations.N Engl J Med.2014;371(8):733-743.
Rivas MA, Beaudoin M, Gardet A, et al.Deep resequencing of GWAS loci identifies independent low-frequency variants associated with inflammatory bowel disease.Nat Genet.2011;43(11):1066-1073.
König K, Peifer M, Fassunke J, et al.Implementation of amplicon parallel sequencing leads to improvement of diagnosis and therapy of lung cancer patients.J Thorac Oncol.2015;10(7):1049-1057.
Shendure J and Ji H. Next-generation DNA sequencing.Nat Biotechnol.2008;26(10):1135-1145.
Schuster SC.Next-generation sequencing transforms today’s biology.Nat Methods.2008;5(1):16-18.
Myllykangas S and Hanlee JP.Targeted deep resequencing of the human cancer genome using next-generation technologies.Biotechnol Genet Eng Rev. 2010; 27: 135–158.
Illumina.High-impact discovery through gene expression and regulation research. https://www.illumina. com/content/dam/illumina-marketing/documents/gated/gene-expression-profiling-e-book-web.pdf.Accessed March 23, 2023.

NGS vs 桑格