面对生物信息学分析时,生物学家们可能会望而生畏。直至最近,分析测序仪的数据仍需要丰富的生物信息学经验。许多实验室只能依靠有限的内部或外部生物信息学家,因此周转时间比较长。分析和解读NGS数据仍然是许多实验室获得深入见解的主要瓶颈。幸运的是,市场上有许多易于使用的分析和解读工具,能够帮助生物学家进行NGS数据分析。
评估生物信息学解决方案需要考虑多个因素:
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因美纳提供有直观、用户友好的软件,可轻松连接测序仪。对于刚刚起步的实验室,因美纳可提供针对单个样本报告、生物标志物发现和群体研究的定制产品。我们的工具可设置为在测序运行完成后立即启动,无需实时监控即可自动返回分析意见或报告。因美纳可提供简便易用的可视化工具和更加准确的二级分析¹,帮助您更快地获得可信赖的分析见解。
我们的分析软件为数据准确性设立了新标准,以更高的查准率和总准确度赢得PrecisionFDA Truth Challenge的行业挑战1。结合因美纳测序仪,Illumina Genome是市场上更准确的分析软件。
不断扩大数字解决方案套件,为研究和临床实验室的多种使用案例和应用提供支持。
因美纳互联软件可为NGS工作流程的每一步提供集成解决方案,涵盖实验室和样本管理直至数据解读。随着手动操作次数的减少,您将更快地获得更深入的见解。
利用精选且全面的点击式分析应用程序菜单和用户友好的图形界面,执行直观的指导性分析。
安全性和隐私性是因美纳软件的核心。企业云端和本地解决方案在构建时都考虑到了全球和地区法规。涉及敏感的基因组数据时,因美纳将是您值得信赖的合作伙伴。
从支持单个样本分析到群体规模分析,我们的解决方案可帮助研究人员根据规模扩展分析。研究人员可以解读单个样本或汇总来自多个来源的数据,从而了解遗传趋势并进行群体规模的发现研究。
“BaseSpace Sequence Hub能让我们分析、储存和传输数据,而不需要生物信息学员工或服务器。没有BaseSpace,我们需要花费更长的时间和更多的成本才能获得这种水平的数据产出和操作效率。”
特色软件工具 | 研究类型和规模 | 生物信息学经验 |
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Clarity LIMS 实验室信息管理系统,用于自动化样本跟踪、工作流程和数据管理。 |
希望扩大规模的受监管实验室 |
从初学者到专家 |
BaseSpace Sequence Hub 简化了运行管理、监控和生物信息学分析。 |
小规模研究:发现研究 |
初学者 |
Illumina Connected Analytics 功能强大的生物信息学软件套件,可对来自因美纳基因测序仪的NGS数据进行高度准确、全面和超高效的二级分析。 |
大规模研究,如群体研究或临床研究 |
中级至专家级 |
DDRAGEN二级分析 DRAGEN平台集成了多种二级分析软件,既可处理NGS数据,又支持三级分析,助力研究人员获取更多见解。 |
小规模到大规模的发现研究、临床研究和群体研究 |
从初学者到专家 |
Emedgene 具有AI优先级排序功能的自动化见解获取解决方案,可以简化WGS、WES、虚拟panel和靶向panel的干实验室工作流程。 |
支持小型和大型实验室寻求用于生殖系研究样本分析的可操作工作流程 |
从初学者到专家 |
Illumina Connected Insights 自动化功能适用于大规模多样化应用和变异类型,可以全面深入地进行变异解读。 |
支持小型和大型实验室寻求用于肿瘤学研究样本分析的可操作工作流程 |
从初学者到专家 |
特色DRAGEN流程和软件工具 | 常用应用 | 推荐仪器 |
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DRAGEN RNA 执行RNA read的定位和比对、RNA定量、基因融合检测和小变异检出。 |
基因表达图谱分析 差异表达分析 生物标志物发现 |
中低通量桌面式测序仪。NextSeq 1000/2000系列基因测序仪具有机载数据分析功能。 |
DRAGEN Targeted Microbial 只需在BaseSpace上轻松点击几下,即可分析因美纳病毒富集panel或平铺扩增子试剂盒(COVIDSeq、IMAP)。通过共有基因组和覆盖图可提供最佳匹配/识别。 |
微生物/病毒测序 |
低通量桌面式测序仪。 |
DRAGEN Enrichment DRAGEN Enrichment流程将DRAGEN的生殖系和体细胞检出程序结合为一个专门为分析富集样本而设计的流程中。包括全套富集指标和报告。 |
外显子组测序 |
具有机载数据分析功能的中通量桌面式测序仪。 |
Partek Flow 易于理解的多组学分析解决方案,采用简便的界面、强大的统计算法、信息丰富的可视化和基因组工具,使各种技术水平的研究人员都能自信地进行数据分析。 |
多组学 |
具有机载数据分析功能的中通量桌面式测序仪。 |
Correlation Engine Correlation Engine是一个交互式组学知识库,能够将私人组学数据置于由经过校正的公共数据构成的生物学背景中。 |
多组学 |
具有机载数据分析功能的中通量桌面式测序仪。 |
*机载数据分析产品因仪器不同而有所差异。
倾听Helix生物信息学部副总裁William Lee和因美纳软件工程部总监Jessica Gordon的介绍,了解Helix如何使用BaseSpace Sequence Hub快速扩展世界上最大的人类外显子组测序操作之一。
阿斯利康基因组学研究、发现科学、研发中心负责人Slavé Petrovski接受了因美纳的采访,讨论信息学和基因组学在药物发现中的作用。
本应用说明介绍了DRAGEN平台在生殖系小变异检出准确性方面取得的新进展,该准确性根据真值集进行衡量。
了解应用BaseSpace Clarity LIMS软件如何使Rapid Novor能够适应未来不断发展的实验室运营需求。