HiSeq 3000/HiSeq 4000的应用和方法

甲基化测序

利用基于测序的DNA甲基化分析所带来的高覆盖度和灵敏度，增强表观遗传研究。

应用指南:

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统上的全基因组亚硫酸氢盐测序

基因表达谱分析

mRNA测序（mRNA-Seq）检测已知和新颖的转录本，测定转录本丰度，实现全面准确的表达谱分析。

应用指南:

HiSeq 4000系统上的基因组、外显子组和转录组分析

编码转录组分析

通过RNA编码区的序列特异捕获，检测RNA外显子组的已知和新颖特征。

DNA-蛋白相互作用分析

将染色质免疫沉淀（ChIP）检测与测序相结合。ChIP-Seq是一种在全基因组范围研究基因调控的强大方法。

靶向DNA测序

靶向重测序将时间、经费和分析能力集中聚焦于一组感兴趣的基因或基因组区域的测序。

小型的全基因组测序

小型基因组测序可提供对微生物或病毒基因组的全面分析，适用于公共卫生、流行病学和疾病研究。

De Novo测序

De Novo测序指的是在没有参考序列的情况下对新的基因组进行测序。NGS可快速、准确地鉴定所有物种。

16S rRNA测序

一种无需培养的、可对复杂微生物组或环境中那些难以研究的细菌进行鉴定和比较的方法。

翻译分析

核糖体分析可实现对细胞翻译过程的系统监控和蛋白丰度的预测。

miRNA和小RNA分析

分离和测序各种小RNA，如microRNA，以研究非编码RNA在基因沉默和转录后调控中的作用。

宏基因组学

通过测序整个微生物群落来开展宏基因组分析，以探索重要的分类和功能信息。

通过测序进行基因分型

Genotyping by sequencing（基于测序的基因分型）提供了一种低成本的遗传筛选方法，可发现新的植物和动物SNP，并开展基因分型研究。

细胞遗传学

新一代测序能以单碱基的分辨率实现对染色体变异的全基因组检测，可与基于芯片的细胞遗传学分析互补。

靶向RNA表达分析

靶向RNA测序（RNA-Seq）聚焦于感兴趣的特定转录本，可用于分析基因表达和鉴定融合基因。

靶向基因集合

靶向基因测序集合包含了针对感兴趣特定基因的指定的探针组。预先设计和定制的集合目前均可提供。