HiSeq 3000/HiSeq 4000系统已停产。在2023年2月28日（HiSeq 3000系统）或2024年3月31日（HiSeq 4000系统）之前，我们将继续提供仪器的全面支持和试剂的供应。我们推荐使用测序平台比较工具寻找替代仪器。
HiSeq 3000/HiSeq 4000规格
性能参数
| HiSeq 3000系统 | HiSeq 4000系统 | |
|---|---|---|
| 每次运行的流动槽数量 | 1 | 1或2 |
| 数据产量 - 2 × 150 bp | 650-750 Gb | 1300-1500 Gb |
| 数据产量 - 2 × 75 bp | 325-375 Gb | 650-750 Gb |
| 数据产量 - 1 × 50 bp | 105-125 Gb | 210-250 Gb |
| 通过过滤的簇（每个流动槽8个通道） | 多达2.5 B单端read或5 B双端read | 多达5 B单端read或10 B双端read |
| 质量分值 - 2 × 50 bp | ≥85%的碱基高于Q30 | ≥85%的碱基高于Q30 |
| 质量分值 - 2 × 75 bp | ≥80%的碱基高于Q30 | ≥80%的碱基高于Q30 |
| 质量分值 - 2 × 150 bp | ≥75%的碱基高于Q30 | ≥75%的碱基高于Q30 |
| 日产出 | ＞200 Gb | ＞400 Gb |
| 运行时间 | ＜1–3.5天 | ＜1–3.5天 |
| 每次运行的人类基因组数* | 多达6个 | 多达12个 |
| 每次运行的外显子数† | 多达48个 | 多达96个 |
| 每次运行的转录组数‡ | 多达50个 | 多达100个 |
安装规格基于在支持的簇密度（1310–1524 K/mm2通过过滤的簇）下的Illumina PhiX质控文库。运行时间仅与测序过程相对应。性能因样本质量、簇密度和其他实验因素而异。
*假设人类基因组的覆盖度大于30倍。
†假设使用2×75 bp的read，覆盖度为100倍，匹配率为80%。
‡假设每个样本5000万条read。
HiSeq 3000系统已停产。我们打算在2023年2月28日之前继续提供仪器的全面支持和试剂的供应。HiSeq 4000系统仍然可用，但我们推荐使用测序平台比较工具来寻找适合您需求的仪器。