检测基因和转录本丰度,并能检测编码RNA和非编码RNA中已知的和新的特征。靶向杂交可去除含量较高的rRNA,让研究人员专注于转录组的高价值部分。
定量基因表达,识别编码转录组中已知的和新的亚型,检测基因融合,测量等位基因特异性表达。
分析一组目标基因的表达。提供定量表达信息以及小变异和基因融合的检测。
使用聚合酶链式反应(PCR)扩增子的超深测序来进行目标RNA序列分析、差异表达分析、等位基因特异性表达测量和基因融合验证。
应用 | 产品 | 优势 |
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总RNA测序 | Illumina Stranded Total RNA Prep |
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mRNA测序 | Illumina Stranded mRNA Prep |
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靶向RNA测序 | Illumina RNA Prep with Enrichment |
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应用 | 全转录组 | mRNA | RNA富集 |
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手动操作时间 | < 3小时 | < 3小时 | < 2小时 |
周转时间 | 约7小时 | 6.5小时 | < 9 小时 |
起始量 | 标准质量的RNA:1–1000 ng;FFPE样本的最佳起始量:10 ng | 标准质量的RNA:25–1000 ng | 标准质量的RNA:10 ng;低质量/降解/FFPE样本的RNA:20 ng |
自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
PCR方案 | 无 | 无 | 有 |
是否需要进行文库定量? | 是 | 是 | 是 |
是否包含片段化过程? | 是 | 是 | 不需要 |
产品 | Illumina Stranded Total RNA Prep | Illumina Stranded mRNA Prep | Illumina RNA Prep with Enrichment |
三种试剂盒都能让您使用384个唯一双标签序列在单个NovaSeq S4流动槽中加载384个样本,进行更高通量的测序,降低测序成本。
连接磁珠的转座酶片段化是我们的文库制备产品系列中采用的创新技术。On-bead tagmentation能让您在将gDNA片段化的同时添加Illumina测序接头,更快地制备可直接用于测序的文库。不需要额外的试剂或仪器即可进行文库归一化。缩短周转时间,降低复杂度。
了解更多我们的NGS文库制备使用的另一项关键技术是接头连接,该技术一直以提供一致、高质量的数据而闻名。文库制备过程中,gDNA或cDNA样本会先进行片段化,然后再将特定的接头连接至片段的两端。这些接头包含完全互补的测序引物杂交位点。无需额外的PCR步骤,实现了完全自动化。
了解更多两种热门RNA文库制备试剂盒的关键性能比较揭示了RNA测序研究人员感兴趣的新信息。
该海报包含了分析下述类型的各类新一代测序方法:
此论文集整理自科学文献,介绍了多种用于RNA测序的NGS方法,包括优点和缺点、文献摘要和参考文献。
使用唯一双标签接头增加每次运行的样本数量,并优化高通量测序。
唯一分子标记(UMI)有助于进行错误校正,能确保准确性,还可在减少假阳性变异检出的同时,提高变异检测的灵敏度。
我们的合作伙伴已经开发了高通量和低通量的自动化方法,可用于我们的文库制备产品系列。
该方法能够在缺乏先前知识的情况下,在单次分析中检测已知的和新的特征,包括转录本亚型、基因融合和单核苷酸位点变异。