MiSeq i100系列规格

快速灵活的测序

测序快速,通量跨度广,数据质量出色

MiSeq i100 systems on benchtop

不同读长下每个流动槽的产出a

什么是读长? 测序读长是指每条已测序DNA片段的长度,可以是单端测序,也可以是双端测序。例如,设置2x150bp进行测序,每个DNA片段可生成2条150bp长度的read (正向反向各一条)。较长的读长,有利于检测DNA序列中跨越重复区域,而较短的读长,则对于那些对基因组覆盖无要求的计数方法学相关应用更具性价比。

流动槽类型 5M b 25M b 50M c 100Mc
1 × 100 bp 2.5 Gb 5 Gb 10 Gb
2 × 150 bp 1.5 Gb 7.5 Gb 15 Gb 30 Gb
2×300 bp 3 Gb 15 Gb 30 Gb

a. 规格是基于支持的簇密度下的Illumina PhiX对照文库所计算。

b. 5M和25M流动槽现已上市。

c. 从2025年起,50M和100M流动槽将仅适用于MiSeq i100 Plus系统。

每个流动槽Reads通过率

什么是reads通过率? 经chastity值过滤后的簇百分比,每个过滤后的cluster可生成1条(单端)或2条(双端)reads。如果前25个循环中chastity值低于0.6的碱基不超过一个,那么这个簇就会保留。单端测序仅从一端对DNA进行测序,是较为经济性的选择。双端测序是从两端对DNA进行测序,更利于重排、新转录本和其他应用的分析。

流动槽类型 5M b 25M b 50M c 100Mc
单端read 5M 25M 50M 100 M
双端read 10M 50M 100 M 200M

a. 纯度的定义是最亮的碱基信号强度除以最亮的和第二亮的碱基信号强度之和的比值。

b. 5M和25M流动槽现已上市。

c. 从2025年起,50M和100M流动槽将仅适用于MiSeq i100 Plus系统。

质量值 a

什么是质量值 ? 质量值或Q值,是对碱基识别错误概率的预测指标,Q值高说明错误率低,Q30表示1/1000的碱基识别错误率,对应的准确率为99.9%。

流动槽类型 5M b 25M b 50M c 100Mc
1 × 100 bp ≥ 90%的碱基分值高于Q30
2 × 150 bp ≥ 90%的碱基分值高于Q30
2×300 bp ≥ 85%的碱基分值高于Q30

a. 在整个测序运行中,≥Q30的碱基百分比取平均值。

b. 5M和25M流动槽现已上市。

c. 从2025年起,50M和100M流动槽将仅适用于MiSeq i100 Plus系统。

运行时间

什么是运行时间? 测序运行时间包括簇生成、机载变性、测序、碱基识别和质量评分的时间累计,所有环节均在设备上完成。

流动槽类型 5M a 25M a 50M b 100M b
1 × 100 bp 约4小时 约4.5小时 约5小时
2 × 150 bp 约7小时 约7小时 约7.5小时 约8小时
2×300 bp 约15小时 约15小时 约15.5小时

a. 5M和25M流动槽现已上市。

b. 从2025年起,50M和100M流动槽将仅适用于MiSeq i100 Plus系统。

对关键应用估计的样本通量a

什么是样本通量? 样本通量是指每个流动槽单次运行中可测序的样本数量。

    每个流动槽的样本数量
应用 每个样本的read 5M b 25M b 50M c 100Mc
转录组学
3'基因表达 1-5M 1-5 5-25 10-50 25-100
靶向RNA panel 1-5M 1-5 5-25 10-50 25-100
mRNA-Seq 10-25M 1-2 1-5 1-10
总RNA-Seq 50M 1 1-2
微生物基因组学
病原体检测 0.5-1M 1-10 1-50 1-100 1-200
16S扩增子测序 0.1-0.2M 1-50 1-250 1-384 1-384
浅鸟枪法宏基因组学 0.5-10M 1-10 1-12 1-25 1-50
鸟枪法宏基因组学测序 10-25M 1-2 1-5 1-10
小型WGSd 0.5M 1-10 1-50 1-100 1-200
靶向基因测序
基于扩增子 0.1-50M 1-5 1-250 1-384 1-384
基于富集 0.1-50M 1-50 1-250 1-384 1-384
基因组编辑 0.1-50M 1-50 1-250 1-384 1-384
免疫组库 2-25M 1-12 1-25M 1-50
质量控制
  Library QC > 0.02M 高达384重 高达384重 高达384重

a. 根据panel和所需的覆盖度,每个样本的read数和样本通量均为估计值,变化很大。

b. 5M和25M流动槽现已上市。

c. 50M和100M流动槽将于2025年起仅可用于MiSeq i100 Plus系统。

d. 基于平均5MB细菌基因组的最小30×覆盖度,估计每个样本的read。

仪器规格

MiSeq i100系列规格a

  • 产出范围b
    1.5–30 Gb
  • 每次运行的双端read
    10–200M
  • 最大读长
    2×300 bp
  • 运行时间
    约4–15.5小时

a. 规格数据是基于在推荐范围内簇密度下的illumina PhiX标准品文库。

b. 最大通量基于100M规格的流动槽,将于2025年发布,且仅适用于MiSeq i100 Plus系统。

关键技术