Infinium XT iSelect-96 Kit

一款全面的芯片解决方案,能够对高达100,000个非人类单种或多种定制变异和50,000个人类定制变异进行生产规模的基因分型。

每年最多>1M0万个样本 范围:100K至>1M0万个样本。

样本通量

每个芯片96个样本

样本数量

50K定制标记

标志物数量

详情请参见规格表

概述

Infinium XT iSelect-96 Kit提供了一种高通量基因分型解决方案,可在任何具有用户自定义内容的物种上进行大规模筛查。Infinium XT解决方案的准确性和可靠性使农业基因组学中的大规模遗传改良计划、生物样本库的大规模筛查以及个性化医疗计划等应用受益。  

  • 生产规模的基因分型——优化的检测和96个样本的BeadChip能够每年处理数十万至100多万个样本

  • 灵活的内容 — 数百至50K SNP的靶向单物种或多物种检测,定制panel的转化率至少保证为95%

  • 高效工作流程——检测总周转时间从3天缩短至2天,手动操作时间更短

简化的样本制备和数据分析

全自动化、高效的Infinium XT工作流程简化了基因分型样本的制备和分析。Illumina Automation Control(IAC)软件的更新和LIMS的集成提高了样本处理效率,而GenomeStudioBeeline软件的增强提供了实时数据生成和按需QC报告功能。 

规格

需要的产品

Infinium XT iSelect-96 Kit仅包含BeadChip和试剂。每个试剂盒按一批处理,不能在多个实验中拆分。订购多个小型试剂盒,用于处理多个低通量批次。

必填: 

  • Infinium XT入门和升级试剂盒 — 为新用户(入门)和新使用XT工作流程(升级)的现有Infinium用户运行Infinium XT检测的硬件和配件

  • Infinium XT Assay PB20 Kit — 浓缩试剂缓冲液  

  • iScan系统 — 用于成像的扫描仪和附件

可选: 

/ 结果

应用

Infinium XT iSelect-96 Kit具有96个样本的BeadChip芯片,支持≤ 50K个可定制标记,支持大规模基因分型应用,包括农业基因组学的遗传改良项目、生物样本库的大规模筛查和个性化医疗计划。

工作流程示例

相关应用和方法

文档

产品资料

比较

Infinium XT iSelect-96 Kit Infinium HTS iSelect Custom Beadchips Infinium Global Screening Array-24 Kit BovineSNP50 v3 DNA Analysis BeadChip
实验分析方法类型 Infinium XT Infinium HTS Infinium HTS Infinium HTS
自动化功能 自动化芯片装载器, 液体处理机器人 自动化芯片装载器, 液体处理机器人 自动化芯片装载器, 液体处理机器人 自动化芯片装载器, 液体处理机器人
说明 Infinium XT iSelect-96 Kit可对通量范围为50K万个样本/年的几乎所有物种进行大规模研究,实现经济高效的基因分型。 1M BeadChip支持多达100K个非人类标记和50K个人类标记,这些标记具有预先验证或新的定制内容。 Infinium HTS iSelect Custom BeadChip让研究人员能够设计一个完全定制的高通量筛查panel,以检测基因组中几乎任何标记的几乎所有物种,以满足他们的研究需求。  Infinium Global Screening Array-24 Kit是用于群体规模遗传学、转化研究、变异筛查研究和精准医学研究的经济型基因分型芯片,结合了优化的多种族全基因组内容、精选的临床研究变异和QC标记。
起始量 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA(150 ng/ul)
系统 iScan iScan iScan iScan
方法 高通量基因分型芯片, 定制芯片 定制芯片 高通量基因分型芯片, 全基因组基因分型芯片 全基因组基因分型芯片
核酸类型 DNA DNA DNA DNA
标志物数量 50K定制标记 最多700K定制标记 654,027个固定标记。自定义标记附加功能: 高达100K  固定标记:53,218个均匀分布的SNP覆盖整个基因组
定制标记物扩展容量:多达600,000(包含+个试剂盒版本)
样本数量 每个芯片96个样本 每张芯片24个样本 每张芯片24个样本
样本通量 每年最多>1M0万个样本 范围:100K至>1M0万个样本。 每周最多5760个样本(8小时内使用2个iScan系统、1个AutoLoader 2x和2个Tecan机器人) 每周约5760个样本
物种 果蝇, 任意, 虾, 哺乳动物, 番茄, 牛, 小鼠, 狗, 酵母, 水稻, 斑马鱼, 绵羊, 仓鼠, 鸡, 猪, 人, 大鼠, 马, 植物, 病毒, 玉米, 线虫, 细菌, 大豆 果蝇, 任意, 虾, 哺乳动物, 番茄, 牛, 小鼠, 狗, 酵母, 水稻, 斑马鱼, 绵羊, 仓鼠, 鸡, 猪, 人, 大鼠, 马, 植物, 病毒, 玉米, 线虫, 细菌, 大豆
技术 Illumina芯片 Illumina芯片 Illumina芯片 Illumina芯片
变异类别 单核苷酸多态性(SNP), 生殖系变异, 插入缺失(indel) 单核苷酸多态性(SNP), 生殖系变异, 结构变异, 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) 单核苷酸多态性(SNP), 结构变异, 拷贝数变异(CNV)

选择工具:

infinium xt workflow improvements

Infinium XT iSelect-96 Kit工作流程改进

每个步骤都在Infinium XT iSelect-96 Kit工作流程中进行了优化,将周转时间从3天缩短到2天。

相关资源

缩略图

Infinium基因分型:DesignStudio Microarray Assay Designer简介

定制内容 (9)

Infinium® XT iSelect-96 Kit (1152 samples)

20006613

该试剂盒包含12个定制BeadChip和管装试剂,能通过Infinium XT-96 Semi-High Throughput(ST)Manual或Automated工作流程以4、8或12 BeadChip批量处理1152个样本。

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Infinium XT iSelect-96 Kit (4608 samples)

20006614

该试剂盒包含48个定制BeadChip和板载试剂,可通过Infinium XT-96 High-Throughput(HT)和Ultra High-Throughput(UHT)工作流程以24或48 BeadChip批量处理4,608个样本。

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Infinium XT iSelect-96 Kit (23040 samples)

20006615

该试剂盒包含240个定制BeadChip和板载试剂,可通过Infinium XT-96 High-Throughput(HT)和Ultra High-Throughput(UHT)工作流程以24或48 BeadChip批量处理23,040个样本。

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Infinium XT Starter Kit (48 BeadChip batches)

20011069

该试剂盒适合刚开始接触Infinium、期望通过Infinium XT工作流程以高通量的水平进行靶向基因分型的客户。试剂盒中包含Infinium XT工作流程中以24 BeadChip批量处理所需的配套设备。Tip Guide、iScan、AutoLoader 2.x和自动化机器人均为单独出售。

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Infinium® XT Starter Kit (24 Beadchips)

20011100

每个Infinium XT Starter Kit含24 BeadChip批量处理所需的所有配套硬件。

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Infinium XT Starter Kit (24 Beadchip) 220V

20031992

Infinium XT Starter Kit(24 Beadchip)220V

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Infinium XT Starter Kit (24 Beadchip) 110V

20031915

Infinium XT Starter Kit (24 Beadchip) 110V

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Infinium XT Starter Kit (48 Beadchip) 110V

20031916

Infinium XT Starter Kit(48 Beadchip)110V

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Infinium XT Starter Kit (48 Beadchip) 220V

20031993

Infinium XT Starter Kit(48 Beadchip)220V

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自动化 (4)

AutoLoader 2.x, Single-Scanner Configuration (110/220 V)

SY-202-1001

包括一台AutoLoader 2.x机器人、五个舱室、10个黑色载体、一个AutoLoader 2.x基板、一个iScan基板、安装、Illumina AutoLoader软件以及一年的标准保修,以支持一个iScan系统。iScan系统单独出售。

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AutoLoader 2.x, Dual-Scanner Configuration (110/220 V)

SY-202-1002

该试剂盒适合想通过双iScan自动上样来最大限度地利用iScan并使样本通量最大化的客户。试剂盒包含一个AutoLoader机器人、五个塔座、二十个载体、基板、安装服务和Illumina AutoLoader软件。iScan单独出售。提供一年标准保修。

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Infinium Automated Pipetting System with IAC (110V)

SC-30-403

该工具包适合想实现Infinium处理自动化和整合LIMS系统(需单独购买)的客户。其中包含用于运行扩增前或扩增后Infinium分析实验方案的LIMS-ready Tecan Freedom EVO 150cm移液设备(配备RoMA ARM),以及机械附件和自动化控制软件。LIMS服务器、软件和许可均为单独出售。

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Infinium Automated Pipetting System with IAC (220V)

SC-30-404

该工具包适合想实现Infinium处理自动化和整合LIMS系统(需单独购买)的客户。其中包含用于运行扩增前或扩增后Infinium分析实验方案的LIMS-ready Tecan Freedom EVO 150cm移液设备(配备RoMA ARM),以及机械附件和自动化控制软件。LIMS服务器、软件和许可均为单独出售。注:该产品不包括Infinium工作流程所需的Te-Flow托架或水循环器试剂盒,它们需要单独订购(PN 20028404)

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仪器 (1)

iScan® 系统 (110/220V)

SY-101-1001

包括iScan Reader、隔离台、计算机、安装和12个月的保修期,以支持Infinium BeadArray产品的成像。适用于电压为100–120 V/220–240 V、50–60 Hz的位置。

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配套产品 (9)

Infinium® XT Assay PB20 Kit

20007420

用于Infinium XT分析工作流程的浓缩(批量)试剂缓冲液。

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Infinium® XT Upgrade Kit (24 Beadchips)

20011101

每个Infinium XT Upgrade Kit含以24 BeadChip批量处理96-XT BeadChip专用的所有配套硬件。

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Infinium XT ST Upgrade Kit (Up to 12 BeadChip Batches)

20015526

每个Infinium XT ST Upgrade Kit含通过ST Automated或Manual处理最高12 BeadChip批量所需的所有配套硬件。适用于已经在运行Infinium Assay,需在其实验室中加入Infinium XT ST工作流程的客户。

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Infinium® 96-XT Tip Guide Set

20011102

每个Infinium 96-XT Tip Guide Set自带3组(每组3个)Tip Guide,可用于将96个样本杂交到每个BeadChip上。

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XT Dual Hyb Insert and Baseplate

20011759

Infinium XT杂交室插件。这些部件有双重功能,既是杂交室插件,也是Tecan上96-XT BeadChip的样本杂交过程中的基板。

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XT Flow-Through Chamber Assembly Tray

20011760

在穿流过程中支持Infinium 96-XT BeadChip的托盘。

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Infinium® XT HT Workflow Training Kit, Reagents Only

20012126

包含用于Infinium XT HT工作流程的板载试剂,仅用于Illumina的现场培训。BeadChip需单独订购——在备注栏说明BeadChip部件号,与客服沟通完成订购。

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XT Hyb Chamber Gasket

20012127

Infinium XT杂交盒垫片,支持DNA样本与BeadChip的杂交

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XT Flow Through Chamber (8 pack)

20012129

XT穿流装置(8包装)

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选择汇总

产品

数量

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常见问题解答

Infinium XT工作流程的主要特点包括:

  • DNA扩增——将批量增加三倍,并缩短孵育时间 

  • 酶法片段化——时间缩短50%

  • 酒精沉淀——删除了30分钟的孵育步骤,干燥时间缩短了75% 

  • DNA重悬——总孵育时间缩短75%

  • BeadChip杂交——使用Tecan机器人系统将样本容量提高三倍 

  • 样本延伸/染色 — 容量增加两倍;每次运行4608个样本

GenomeStudio软件是基于芯片的基因分型数据的Illumina可视化和分析程序。软件的重要更新提高了基因型簇生成的速度,缩短了整体分析周转时间。 

 

Beeline软件是Illumina芯片数据分析工具,用于预过滤和报告高通量处理的数据。这使其成为任何大规模Infinium基因分型项目的理想选择。

DesignStudio软件包含定制基因分型芯片探针设计程序,可通过引导式易用界面开发和订购定制内容,保证至少95%的定制内容转化率。

Infinium XT iSelect-96 Kit可使用当前的Infinium自动化技术(即Tecan机器人、LIMS和检测辅助硬件)进行处理。优化Tecan液体处理机器人的IAC软件,通过PCR前液体转移步骤提高效率并节省时间,同时LIMS软件的更新支持整个过程。为了支持新格式并缩短手动操作时间,需要更新一些配件硬件。 

Infinium XT iSelect-96 Kit解决方案经过设计和优化,旨在支持希望使用自动化工作流程扩展Infinium实验室的客户。客户必须批量处理96个样本才能处理一个BeadChip芯片,每次运行至少处理1152个样本才能优化试剂使用。每年处理<50K个样本的实验室可能会延长最终用户的周转时间,并且可能无法证明自动化采购的资本支出是合理的。 
/ 结果

NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

与早期版本相比,优化的试剂盒可增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

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