抢先体验用户对因美纳全新的MiSeq i100系列赞不绝口

三大洲的实验室管理者对测序仪的易用性、速度以及室温试剂运输和储存表示赞赏

抢先体验用户对因美纳全新的MiSeq i100系列赞不绝口
魁北克基因组中心的Geneviève DonPierre、巴黎脑部研究所的Yannick Marie和澳大利亚基因组研究机构的Christopher Noune。照片由拍摄对象提供。
2024年11月25日

自2011年推出初代MiSeq测序仪后,它就在因美纳的测序仪产品组合中占据了重要地位,从那时起,研究人员就一直使用其来深入探索基因组。

因美纳将于2024年隆重推出其后续产品:MiSeq i100和MiSeq i100 Plus测序仪。两款仪器将更加快速、更简便易用,并且融入台式测序仪的首次创新——它们的试剂可以在室温下运输和储存,解决了冷链控制固有的处理和解冻问题。

在新产品发布前进行的最后准备工作中,因美纳要求全球实验室自行测试MiSeq i100系列,并了解仪器进展如何改善他们的日常运营,甚至促进新应用的发展。

三位研究人员特别分享了他们的见解:Yannick Marie,巴黎脑部研究所基因分型/测序平台运营经理;Christopher Noune, 澳大利亚基因组研究机构国家实验室运营经理;Geneviève DonPierre,非营利组织魁北克基因组中心的NGS测序团队负责人。

各方面均获得正面反馈

三位科学家和他们的团队首先注意到的是,他们可以非常轻松地启动和运行MiSeq i100系列。另外,他们无需因美纳代表的帮助即可自行拆包并安装,而且其小巧的体积也是优点之一。“我们可以随意地把它放在工作台上,”Marie说,“安装完成后,一小时后我们就可以启动首次运行。而且它外形美观,真是一款非常不错的仪器。”

对此Noune表示赞同,他称其为“一个相当可爱的小设备,它基本上是一个迷你版的NovaSeq X,直观易用,不像其他上代测序仪那么复杂。”

DonPierre预见到其他实验室将会发现MiSeq i100的实用性,并表示它“对新手来说很容易上手操作”。她还指出了它可以弥补低通量系统和高通量系统之间的差距:“仪器越大,产出越大;但有时你运行的项目比较小,无法在大型流动槽上将它们与较大的项目结合起来。有了这个新工具,我们能够为小型项目或需要尽快确定是否应该继续执行项目的研究人员快速提供答案。”  

快速找到答案是这些测序仪真正的优势所在。基因组学服务客户的夙愿就是在当天获取结果——对于这些时间紧迫的项目,MiSeq i100系列已然实现这一目标。此前,巴黎脑部研究所能够在大约20天内向客户提供FASTQ数据。现在,Marie表示,“我们可以在早上开始运行,下午刚开始时就能得到结果。我们能够在一天之内启动完整的文库制备工作。虽然这要经历漫长的一天,但一切皆有可能。对于我们来说这确实是一个新模式。”

测序速度也一直是澳大利亚基因组研究机构面临的三大挑战之一。但Noune指出了新测序仪的几大优势:“它不易出现过度成簇;对于低多样性文库而言,标签read优先测序是一个颠覆性改变。我们可以从运行初始就获取样本拆分统计数据。借助这个新系统,我们每天都可以生成高质量的数据。它可能是目前最快速的测序仪。”

对于周转时间的改进,最具影响力的改变之一是所有MiSeq i100系列的耗材和试剂都可以在室温下运输和储存。“我翘首以盼多年,”DonPierre说道,“我们再也不用提前两天从冰箱里取出试剂盒——如今试剂随时可用,您可以在15分钟内计划并开始运行。”

“我们不必处理更多的冰箱空间,”Noune补充道,“我们的职业健康和安全要求因此放低,因为我们不必担心干冰的伤害;包装也非常轻盈。”

成就超乎想象的可能

测试过MiSeq i100系列的所有研究人员都表示,这些仪器将扩展他们实验室能够承担的应用类型。Marie预测,巴黎脑部研究所可以使用该系统进行单细胞分析,而这在运行规模更大的测序仪上则不一定能实现。

Noune相信测序仪将对他团队的微生物分析和质粒测序服务产生重大影响。“质粒测序已经成为药物研发的重要组成部分,”他说,“这类测序仪为我们提供了更大的灵活性;我们期待看到它将如何为澳大利亚基因组研究机构开辟新的机遇。”

在魁北克基因组中心,DonPierre表示:“我们很可能会使用这种新仪器对宏基因组项目进行测序。我们有一些研究人员使用细胞培养或动物研究,他们需要快速获得答案——尤其是对于CRISPR研究——他们不能花费数周时间等待测序数据返回。”

回顾MiSeq i100系列的所有优势,DonPierre恰当地总结道:“快速简便、无需工程师到场即可自行安装,运行设置快速轻松、试剂储存无需放入冰箱,搭配可以生成分析报告的DRAGEN服务器,对于不一定能应对大型数据分析的团队来说非常友好——借助这个新系统,因美纳可以使台式测序贯穿整个过程。”◆

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