2024年11月26日
接受全面基因组分析（CGP）的晚期癌症患者有机会收集除可能与他们相匹配的特定基因之外的更多信息，以进行临床试验或靶向治疗。CGP是一种分析数百种癌症生物标志物的新一代测序方法，它不仅可以识别体细胞突变，还可以识别与遗传性癌症风险相关的生殖系变异。
在位于宾夕法尼亚州的阿勒格尼健康网络（AHN）进行的一项研究中，研究人员探索了从内部CGP结果到其癌症遗传学部门的转诊模式，以及这种渠道的影响。在这项研究中，473名晚期癌症患者接受了肿瘤样本的CGP检测。AHN分子诊断实验室使用其523基因AHN泛癌症panel对样本进行测序和分析，寻找可操作的治疗靶标。
癌症遗传学团队对每份CGP报告进行人工审查后，发现66名个体存在潜在的生殖系变异。这类信息不仅对患者有用，而且对他们的家人也有用。例如，如果接受黑色素瘤治疗的患者的CGP报告中确定存在BRCA突变，并且后续检测证实该突变确实是生殖系突变，他们就会被告知罹患乳腺癌、卵巢癌、胰腺癌和其他癌症的风险增加。这一发现还可以让他们的家庭成员接受检测，确定他们是否携带家族突变从而增加患癌症的风险。“因为我有遗传咨询师的背景，所以我很高兴看到这些数据，”因美纳肿瘤医学事务副主任Emily Dalton说道，“遗传性癌症检测提供的信息对患者的癌症风险、筛查和预防至关重要，我们应该利用一切机会提高对它的认识。”
这项研究的合著者Dalton最近展示了一张海报，题为“基于社区的综合癌症医疗网络内部综合基因组分析中的潜在生殖系变异：发病率和转诊模式探索”，分子病理学协会（AMP）2024年不列颠哥伦比亚省温哥华年会和博览会。
报告中含有生殖系注释的AHN患者中有三分之一被转诊至癌症遗传学诊所，但并非所有人都选择进行确认检测。这项研究虽然规模不大，但发现有五个人最终被检测出有生殖系致病或可能致病的变异，并能够采取行动。“这对那些病人来说意义重大，”Dalton说。
我们的研究结果表明需要对体细胞肿瘤检测中检测到的生殖系变异进行标准化报告。
尽管CGP旨在用作体细胞测试，但它可以揭示对个体具有重要意义的生殖系变异。但是，生物信息学和报告软件不仅在捕获或标记的内容上存在差异，而且医疗系统之间的工作流程和方案也不同。目前，尚无一致、统一的流程来标记生殖系变异并传递或跟进该信息。CGP报告中的潜在生殖系标记为患者提供了另一种发现重要遗传风险信息的途径，但前提是进行适当的跟进、转诊和检测。
“我们的研究结果表明，需要对体细胞肿瘤检测中检测到的生殖系变异进行标准化报告，”合著者兼AHN首席基因组学技术官William LaFramboise说道，“我相信，我们正在进行的体细胞CGP测试可以定期捕获与疾病有关的生殖系变异，并可以提供系统的流程来确认或排除潜在的生殖系疾病变异。这可以直接改善患者护理。”
今年，美国临床肿瘤学会发布一般建议用于癌症患者的生殖系检测，但这些建议不是明确或规定性的。
支持者认为，帮助癌症患者避免患上另一种癌症是有益的，并且可能帮助他们的家人避免风险。◆
该研究的作者：Kyla Morphy、Emily Bober、Megan Blauvelt、Avani Ahuja、Patti Petrosko、Emily Dalton、John Nakayama、David Bartlett和William LaFramboise。
