仪器

NovaSeq 6000基因测序仪规格

强大性能，触手可及

可扩展、易调谐的高输出测序

NovaSeq 6000 system render

不同读长下每个流动槽的输出a

读长 SP S1 S2 S4
1 × 35 bp N/A N/A N/A 280–350 Gb
2 × 50 bp 65–80 Gb 134–167 Gb 333–417 Gb N/A
2×100 bp 134–167 Gb 266–333 Gb 667–833 Gb 1600-2000 Gb
2 × 150 bp 200–250 Gb 400–500 Gb 1000–1250 Gb 2400–3000 Gb
2 × 250 bpb 325-400 Gb N/A N/A N/A

a. 输出规格基于支持簇密度下Illumina PhiX对照文库的测序表现。

b. 最大读长。

每次运行的输出a

读长 SP S1 S2 S4
1 × 35 bp N/A N/A N/A 560–700 Gb
2 × 50 bp 130–160 Gb 268–334 Gb 666–834 Gb N/A
2×100 bp 268–334 Gb 532–666 Gb 1334–1666 Gb 3200–4000 Gb
2 × 150 bp 400–500 Gb 800–1000 Gb 2000–2500 Gb 4800–6000 Gb
2 × 250 bp 650–800 Gb N/A N/A N/A

a. 输出规格基于两个使用Illumina PhiX对照文库在支持的簇密度下同时运行的流动槽。

对关键应用估计的样本通量a

应用 SP S1 S2 S4
每次运行的人类基因组数 ~4 ~8 约20个 ~48
每次运行的外显子组 约40 约80 约200个 约500
每次运行的转录组 ~32 约64个 约164个 约400

a. 所有的样本通量是基于双流动槽运行的估计值。对于人类基因组，假设每个样本能够生成> 120 Gb的数据，从而实现30×的基因组覆盖度。外显子组假定~8 Gb/100×。对于转录组，假设能够生成≥ 50M read。通量可能因使用的文库制备试剂盒不同而异。

每个流动槽中可产生的合格簇a

Read类型 SP S1 S2 S4
单端read 650–800M 1.3–1.6B 3.3–4.1B 8–10B
双端read 1.3–1.6B 2.6–3.2B 6.6–8.2B 16–20B

a. 所有样本通量均为估计值，基于双流动槽运行。人类基因组假设每个样本的数据＞120 Gb，以实现30倍的基因组覆盖度。外显子组假设约8 Gb/100×。转录组假设read≥50M。通量可能因使用的文库制备试剂盒不同而异。

质量分值a

读长 SP S1 S2 S4
1 × 35 bp N/A N/A N/A ≥ 90%的碱基分值高于Q30
2 × 50 bp ≥ 90%的碱基分值高于Q30 N/A
2×100 bp ≥ 85%的碱基分值高于Q30
2 × 150 bp ≥ 85%的碱基分值高于Q30
2 × 250 bp ≥ 75%的碱基高于Q30 N/A N/A N/A

a. 使用Illumina PhiX对照文库，基于NovaSeq 6000 Reagent Kits v1.5的质量分值。

运行时间a

读长 SP S1 S2 S4
1 × 35 bp N/A N/A N/A 约14小时
2 × 50 bp 约13小时 约13小时 约16小时 N/A
2×100 bp 约19小时 约19小时 约25小时 约36小时
2 × 150 bp 约25小时 约25小时 约36小时 约44小时
2 × 250 bp 约38小时 N/A N/A N/A

a. 使用Illumina PhiX对照文库，基于NovaSeq 6000 Reagent Kits v1.5的运行时间（同时运行两个流动槽）。

仪器规格

NovaSeq 6000 system specifications

NovaSeq 6000仪器规格

  • 仪器配置
    计算机和触摸屏显示器 安装设置和配件 数据采集和分析软件
  • 仪器控制计算机
    注：计算机配置将定期升级，请联系您当地的客户经理，了解当前的配置
    主机：Portwell WADE-8022及Intel i7 4700EQ CPU
    内存：2 × 8 GB DDR3L SODIMM
    硬盘：无
    固态硬盘：256 GB mSATA
    操作系统：Windows 10
  • 操作环境
    仅供室内使用
    温度：19°C-25°C（22°C ±3°C），<2 °C change per hour
    湿度：相对湿度20%-80%，非冷凝
    海拔：低于2000米（6500英尺）
    通风：最大8530 BTU/h，平均6000 BTU/h
  • 激光
    波长
    532 nm、660 nm、780 nm、790 nm
  • 带显示器的尺寸
    W×D×H
    80.0 cm × 94.5 cm × 165.6 cm
    （31.5 英寸 × 37.2 英寸 × 65.2 英寸）
  • 重量
    481 千克（1059 磅）

    泄漏托盘为3.5 kg（7.8 lb），键盘和鼠标为0.9 kg（2 lb）
  • 包装尺寸
    W×D×H
    92 厘米 × 120 厘米 × 118 厘米
  • 毛重
    628 kg（1385磅）
  • 电源要求
    200–240 VAC 50/60Hz，16A，单相，2500 W 因美纳提供特定区域的不间断电源
  • 网络连接
    仪器和数据管理系统之间专用的1 Gb连接。直接连接或通过网络连接
  • 网络连接带宽
    内部网络上传速度：200 Mb/s/仪器
    BaseSpace Sequence Hub上传速度：200 Mb/s/仪器
    仪器操作数据上传速度：5 Mb/s/仪器
查看详细规格表（PDF）

关键技术

边合成边测序技术

NovaSeq 6000基因测序仪采用经过验证的因美纳边合成边测序（SBS）化学技术提供准确的数据和稳健的性能。SBS化学技术使用荧光标记的核苷酸作为可逆终止子。该方法在单碱基进入不断增长的DNA链时发现它们，并行读取数十亿个序列。

阵列式流动槽技术

NovaSeq 6000基因测序仪整合了图案化流动槽技术，能够为一系列广泛的测序应用生成出色的通量。阵列式流动槽在固定的位置包含数十亿个纳米井，这种设计甚至为待测序的簇之间提供了间隔距离。这大幅提升了系统的测序read以及总输出。