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萌芽于酒吧中的创新之路

回顾发明家、Solexa联合创始人Colin Barnes博士的职业生涯

萌芽于酒吧中的创新之路
2022年8月10日

如今,我们很难想象一个没有测序技术的世界。然而,就在几十年前,测序还是一种高度专业化的独家技术,在全球范围内也仅有少数人有能力使用这种技术。要想改进这种技术并将其拓展应用于全球数以万计的实验室,需要科学家们苦心钻研,不断改进完善。现年50岁的Colin Barnes博士在位于剑桥附近的办公室里回忆往事,讲述了因美纳测序平台背后的边合成边测序(SBS)技术是如何从几十年前的一个想法发展至今的。

1997年夏天,Barnes成为了剑桥大学的一名新任博士后研究员。剑桥大学的两位学者Shankar Balasubramanian和David Klenerman偶尔会在化学系附近的Panton Arms酒吧召开小组会议。Barnes和同为博士后研究员的Mark Osborne出席了其中的一次小组会议。现在看来,那次会议可以被视为一次具有历史意义的头脑风暴讨论会,他们在会上讨论了一种将被证明比其他测序方法更快、更具成本效益的测序方法(当时,人类基因组计划已经进行了七年,还需要六年才能完成,总成本约为30亿美元,而到了2020年,因美纳已将人类基因组测序的成本降至约600美元)。

1997年,所有商业测序都使用凝胶电泳,按长度分离寡核苷酸片段。当时,刚攻读完核酸化学博士学位的Barnes在Panton酒吧里谈到了一种方法——使用具有化学可逆终止子的标记核苷酸并进行循环测序,通过每次添加一个碱基来延伸固定链。在接下来的几年里,这种方法被广泛称为边合成边测序(SBS)。SBS是一种新一代测序技术,它利用成像来检测单个碱基,因为它们会连续并入数百万条不断延伸的DNA链中。Barnes博士于1997年启动了实验。次年,该小组成立了Solexa有限公司。作为联合创始人之一,Barnes博士为Solexa推出的SBS技术的研发做出了贡献,并且是Solexa早期专利的发明者。该公司于2000年搬离剑桥化学系,拥有了属于自己的办公场所,而Barnes博士和Osborne博士则成为了公司的前两名员工。

2006年,总部位于圣迭戈的因美纳收购了Solexa。直至2010年,Barnes博士继续以因美纳员工的身份为SBS技术的发展做出贡献。Barnes博士表示:“对我而言,能够见证一个想法从诞生到实现的整个过程,能够与一群才华横溢的人共同开发一个实用的商业系统是一种巨大的荣幸。这项研究以我们起初从未预料到的方式进行,但这正是科学的乐趣之一。”

因美纳的研发团队不断发展壮大,目前已有2,000多人。公司为员工设立了一个发明家表彰项目,其中包括年度创新奖,而Barnes博士曾在2007年获得该奖。此外,因美纳的女性发明家比例高于平均水平,而且每年都会在美国庆祝国家发明家日。Barnes博士于2007年获得的创新奖就放在他家中的办公桌上。他对年轻科学家的建议是享受旅程,看看它能把你带到哪里。Barnes博士说:“研究工作未必总能如你所愿,但是,你应当将工作中遇到的困难视为一种历练,它会帮助你发现未来的好机会。”

Barnes博士目前是剑桥的一名非常成功的专利律师,而且还是50多项欧洲专利和美国专利的指定发明人,这些专利与其在Solexa和因美纳的工作相关。今年恰逢Solexa成立25周年,让我们为创新,为合作,为在Panton酒吧度过的那个难忘之夜后获得的一系列专利举杯庆祝!

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